JPK składa się z siedmiu struktur - JPK_KR, JPK_WB, JPK_MAG, JPK_VAT, JPK_VA, JPK_PKPIR, JKP_PKPIR.
JPK przynosi korzyści głównie administracji podatkowej, która może szybko i sprawnie przeprowadzać czynności sprawdzające jak i kontrolne. Dane są usystematyzowane co pozwala na prędkie wykrycie nieprawidłowości jak potwierdzanie prawidłowości rozliczeń. Dzięki JPK można skuteczniej bronić się przed negatywnymi zjawiskami takimi jak wyłudzenia VAT czy unikanie opodatkowania.
Warto jednak nadmienić, że JPK przynosi pozytywne skutki dla przedsiębiorców - skrócenie czasu kontroli skarbowej, zmniejszenie jej uciążliwości ale i zmniejszenie kosztów. W wielu przypadkach przekazanie pliku JPK odbywa się w ramach czynności sprawdzających dzięki którym sama kontrola podatnika nie będzie wcale już potrzebna.
Przedsiębiorcy zyskują mechanizm pozwalający sprawdzanie pracy księgowych. JPK został wprowadzony już od 1 stycznia 2016 roku ale początkowo do jego stosowania zobowiązane były tylko duże przedsiębiorstwa, później też małe i średnie firmy podczas gdy od 1 stycznia 2018 roku obowiązek ten obejmuje też mikro przedsiębiorców.
